故事发生在箱庭学园黑神目泷丰崎爱生配音是学园一年级的新生作为学校里的学生会长黑神拥有完美的外表优异的成绩强健的身体和丰厚的家底如此完美的女神在生机勃勃的校园里会遇见怎样有趣的故事呢人吉善吉小野友树配音是黑神的青梅竹马两人从小玩到大彼此之间感情十分要好作为支持率百分之九十八的学生会长黑神联手人吉善吉设置了意见箱同好友阿久根高贵浪川大辅配音喜界岛枫夏芽野爱衣配音等人一起解决校园中的各类疑难杂症然而随着黑神的势力越来越大一些不友好的声音随之而来